Az elmúlt években megújult a hajóállomás: a modern kétszintes, új úszóműben kikötői funkciók, jegypénztár, váróterem, szolgáltatói helyiségek vannak kialakítva, valamint száz fő befogadására alkalmas konferenciaterem, mely bérelhető esküvőkre és egyéb rendezvényekre. Az úszómű telepítése mellett a parti terület is rendezésre került, zöldövezet, kerékpártárolók, parkolók épültek, padok kihelyezésére került sor. A fejlesztéssel az utazóközönség maximális kényelmének kiszolgálása valósult meg. Az esztergomi kikötő az áprilistól szeptemberig tartó szezonban, saját menetrendi kirándulóhajó és szárnyashajó járat mellett kabinos hajókat is fogad.